no lee javascript, ni poniendo lo abajo, porque??porque se ponen antes </body>

[gachon]

hola muy buenas,
Estoy intentando resolver, porque algunas funciones de javascript relacionadas con jquery, no la interpretan poniendolo en el head,,, he visto en un ejemplo de web que tengo que esta puesto antes del final de la etiqueta del </body> y lo he intentado cambiar al head y no funciona,,,, y ahora para colmo estoy intentando poner un slider jquery de imagenes, y no me funciona tanto en el head como abajo,,,
me podrian explicar el porque,de porque se ponen los archivos javascript antes del </body> y como se puede arreglar.
muchas gracias y espero vuestra ayuda