que versión de Thunderbird estas usando, la 2.x o la 3.x y es la versión para Windows (XP, Vista, Win7) o para Linux.
cuando dices que activaste la opción de correo basura te refieres a:
menú herramientas - opciones - seguridad - basura
o a esta otra...
menú herramientas - configuración de las cuentas - correo basura
con el primer correo que se considere como correo basura debería crearte una carpeta llamada "basura" aparte de "papelera".