Gracias jejejejejej tenias razón con el AND me funcionó es que los operadores en las consultas fulltext no sabía que funcionaban igual XD pero ya quedó de esta forma por si a alguien despistado como yo lo necesita
Código PHP:
SELECT * FROM empresas WHERE MATCH (empresa, giro, delegacion) AGAINST ('$campo' ) AND delegacion='$delegacion' ORDER BY paquete DESC