Holas, Gunmanspeed.
Claro que puedes subirlos. Mientras la carpeta de destino exista, no habrá problemas. Eso sí, si pasas luego la página a un servidor Linux, aparte de existir, la carpeta debe tener permisos de escritura para permitir que guardes archivos en ella usando php. (De cualquier forma, si tienes los permisos necesarios, también puedes crear la carpeta en tiempo de ejecución desde php.)
Para subir archivos con php investiga
move_uploaded_file(), y no olvides agregar en el formulario HTML el
Código:
enctype="multipart/form-data"
.
Saludos!