cuando quieras una fila roja le agregas una clase, por ejempo:
 
<td class="rojo_td">contenido de la celda</td> 
Después escribes el CSS de esta forma: 
.rojo_td{
  background: #FFF;
} 
y 
lo pones en una hoja CSS o en el head. 
Después haces lo mismo con el verde o con cualquier otro color.