Bueno eso no es tanto de PHP sino SQL.
Para hacer una consulta de 2 tablas tienes que relacionarlas.
Ejmplo clasico
TABLA EMPLEADO - *COD_EMPLE , NOMB ,
DEPT_ID
TABLA DEPARTAMENTO -
*ID NOMBRE_DEPT
Aqui tenemos 2 tablas que se relacionan por EMPLEADO->DEPT_ID , DEPARTAMENTO->ID
Esta seria la consulta natural .... tal y como las puesto tu.
SELECT NOMB , NOMBRE_DEPT FROM EMPLEADO,DEPARTAMENTO ;
Pero nos falta la relación
SELECT NOMB , NOMBRE_DEPT FROM EMPLEADO,DEPARTAMENTO
WHERE EMPLEADO.DEPT_ID = DEPARTAMENTO.ID;
Una vez hecho esto ya le puedes añadir mas condiciones.
AND EDAD > 30
un
group by con having.. etc...
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NOTA: Recuerda que si usas un group by solo podras poner , funciones de grupo , campos agrupudas, constantes...
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/...functions.html