Gracias por tu respuesta:
 
A cada checkbox le di una clase,  si quiero marcar la clase vehiculo el script quedaria de la suiguente forma??  
Código:
 function Chequear(chkbox) 
{ 
for (var i=0;i < document.forms["form1"].elements.length;i++) 
{ 
var elemento = document.forms[0].elements[i]; 
if (elemento.class == "vehiculos") 
{ 
elemento.checked = chkbox.checked;
} 
} 
}
  La verdad es que soy un poco nuevo en esto, muchas gracias.