el primer problema que se aprecia es que estás duplicando las id's tantas veces como celdas tienes la tabla. como estás obteniendo las notas de una bd no te será difícil asignarle un valor numérico a cada div
Cita: <div id="mostrarDiv1"><a href="javascript:mostrardiv('flotante1');">Mostrar Div</a></div>
<div id="flotante1" style="display:none;"> '.$usuario['notas'].' <br><a href="javascript:cerrar('flotante1');">Cerrar</a></div>