Muchas gracias de nuevo por tu interes
Ya he resuelto el problema. Investigando un poco en los foros de PHP (Por que tambien pensaba que ahi estana el problema), descubri que para consultas con valores varchar, php solamente admite hasta 255 caracteres.
Al igual buscando en un foro de php descubri la forma de hacer que mi consulta me regresara mas de esos caracteres, lo unico que hice fue hacer un cast al select de mi consulta, y cambiar el valor devuelto de varchar a text.
Código PHP:
$sql ="select cast(Cadena_original as text) as cadena from FacturaE where serie_documento='".$_GET['serie']."' and folio_documento=".$_GET['folio']." and tipo_documento='FAC'";
eso fue mas que suficiente para que PHP me regresara el valor completo de la columna.
De nuevo muchas gracias por tu interes
, espero que a los que tengan el mismo problema les sirva esto