Correr un javascript dentro de un if de PHP

[Diosus]

Gracias pateketrueke; si reconozco la forma de trabajo de PHP y Javascript creo que me falto extender más la consulta, sin embargo agradezco la aclaración; lo que me hace falta conocer es como puedo parsear el javascript o como PHP puede escribir el código javascript como se hace con HTML; echo "<br>dd......";

Tal como lo he dejado

Código PHP:

#
?>
#
 
#
<script languaje="javascript">
#
    comprobar();
#
</script>
#
 
#
<?
 

Separando el PHP del Javascript no lo carga, ejecuta o corre.
Gracias por la atención