Positioning

[sanxuan]

Puedes probar estas propiedades:

Código CSS:

.footer {
    background-color: #00FF99;
    bottom: 0;
    height: 50px;
    margin-top: -50px; /* El alto del footer */
    position: absolute;
    width: 100%; /* aquí no sé porqué no aparece correctamente el 100% */
}
.contenedor {
    min-height: 100%;
    padding-bottom: 50px; /* El alto del footer */
    position: relative;
}
 

Comprueba el código porque aparece el footer en otra parte del HTML dentro de contenedor y podría aparecer duplicado.