El primer problema que veo es la ausencia de la DTD, que es la definición de tipo de documento, dentro de la etiqueta <!DOCTYPE>.
Puedes probar con esta:
<!-- DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd" -->
Conviene que te vayas acostumbrando a usar XHTML, las diferencias con HTML4.0 son mínimas, aunque es más exigente a la hora de cerrar etiquetas, etc...
Hay otras cabeceras que te servirán igual. Sin esa declaración IE utiliza su modo original de presentación en lugar del que sigue los estándares del W3C.
A continuación deberías validar tu página siguiendo el siguiente enlace
http://validator.w3.org/unicorn
Aparecen algunos errores que debes subsanar. Si un código no es válido no hay garantías de que se vaya a mostrar bien.
No creo que vayas a necesitar una hoja especial para IE. Si llegase a ser necesaria, deberías incluir en ella sólo las propiedades que son diferentes para IE y no todas, ya que tu hoja de estilo (estilo.css) se ha cargado de todas formas con anterioridad.
Voy a seguir echándole un vistazo para poder ofrecerte alguna sugerencia más.