porque no haces un php que te redireccione a la descarga y agrege el hit a la db todo en el mismo??
Código PHP:
$query = "SELECT * FROM `".$_GET['clasification']."` WHERE id = ".$_GET['id']." LIMIT 1";
$resultado = mysql_query ($query, $dbConn);
$row = mysql_fetch_assoc ($resultado);
$new_downloads = $row['downloads'] + 1;
$query = "UPDATE `".$clasification."` set downloads = '$new_downloads' WHERE id = '".$row['id']."'";
$result = mysql_query($query, $dbConn);
header( 'Location: '.$row['link'].'' );
die;
te lleva al link de descarga, pero antes agrega 1 hit al link.