Las expresiones regulares son tus amigas ;)
Código PHP:
Ver original$code = preg_replace( "#<div name=\"div_x\">equis<hr name=\"hr_x\"></div><div></div>#is", "<div name=\"div_x\"></div><div></div>",$code);
Ese código que te he puesto hace lo que pides, aunque supongo que querrás algo más elaborado, cambiando las
x por números y cosas así. Pero la idea por donde empezar, ya la tienes sobre la mesa :)