Hola!
Yo tambien he tenido que hacer eso muchas veces, en lo particular utilizo el módulo custom search para crear el formulario de búsqueda, y el módulo CSS Injector para darle estílos al formulario.
Para ubicarlo en la parte superior, coloco en el page.tpl.php del tema un div mas o menos con esta estructura:
Código PHP:
<div id="search" class="layout-region">
<?php print $search_box; ?>
</div>
Lo colocas en donde deseas que aparezca.
Espero que te sea de utilidad!
Saludos!