Por default MySQL no indexa palabras de tres caracteres o menos, si realmente te interesa que pueda funcionar asi (aunque no parece ser tan util realmente), puedes probar a cambiar el parametro
ft_min_word_len, san google puede ayudarte a encontrar como aqui:
http://www.google.com.mx/search?hl=e...t_min_word_len
Si estas en un servidor gratuito o compartido, dudo que puedas realizar ese cambio.