Entonces puedes usar este código, a ver si te vale
Código PHP:
$n=0;
foreach($array as $valor){
$encontrado=array_search(1, $valor);
if ($encontrado){
$cont[]=$n;
}
$n++;
}
foreach($cont as $key){
unset($entrada[$key]);
}
$array = array_values($array);
Es lo primero que se me ha ocurrido. Seguramente se podrá simplificar porque en php hay cantidad de funciones para todo.
Un saludo.