PHP no se puede meter dentro de JavaScript, lo que si se puede hacer es generar el JavaScript con PHP:
   
Código PHP:
Ver original<?php
    echo "<script type='text/javascript'>alert('El usuario: ".$var1." y el password: ".$var2."han sido dados de alta correctamente');</script>";
?>
  
o bien puedes imprimir desde php el contenido de las variables dentro del javascript
:   
Código Javascript
:
Ver original<script type="text/javascript">
alert("El usuario: "+<?php echo $var1;?>+" y el password: "+<?php echo $var2;?>+" han sido dados de alta correctamente");
</script>
  
una manera mas corta en imprimir el contenido de una variable es utilizando los short tags que deben estar activados en tu php.ini 
forma normal:
<?php echo $var1; ?> 
forma corta:
<?=$var1?> 
Espero haberte ayudado.