Bueno, el tema del intercambio de enlaces es el pan nuestro de cada día en esto del Seo. Se llegó a comentar hace tiempo que podía llegar a ser perjudicial, pero a día de hoy se tiene como algo normal. Como en todo, depende de la forma en realizarlo que te de mejor resultado o que pueda ser mal visto. No me metas una página con cien enlaces salientes en páginas amigas.
Es lo mismo que realizar intercambios desde el footer de tu página home. Los hay que lo hacen con precaución, y otros que tienen el footer lleno de enlaces, vamos el pie lleno de ampollas.
Aquí te dejo enlace a un video interesantísimo sobre el tema en el que Matt Cutts despeja algunas duda y en el que habla de forma bastante natural sobre este tema.
http://posicionamiento-buscadores.la...ces-reciprocos