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PHP 6.
Tomando en consideracion que en el
sitio oficial se acaba de liberar la version 5.3.6, que ahi no se habla todavia de la version 6 y que la tendencia ahora va por PDO en lugar de simplemente MySQL, sugeriria buscar un libro (o tutoriales) mas adecuados a lo que quieres aprender.
En teoria no requieres conocimientos de HTML, CSS o Javascript para programar en PHP, pero, en la practica PHP es usado principalmente para desarrollos web, por lo que es imprescindible que tengas al menos las bases.