se puede imprimir en forma local?

[Nemutagk]

A ver, que es lo que quieres hacer? como que utilizar PHP como intranet?, ejecutar el programa como system? has dicho muchas cosas pero no has explicado nada, en primera que tipo de "programa" es?, que tipo de interacción estas intentando tener entre PHP y la aplicación?.....

Por lo que lei lo que estas intentando es imposible, supongo que el "programa" que dices es una aplicación con interface grafica, por lo tanto necesitas de teclado y mouse para interactuar, si es así no se quien te dijo que ejecutando una sentencia system puede correr aplicaciones via lan, pero definitivamente te ah tomado el pelo, si de verdad es lo que quieres hacer no te queda mas que levantar una vnc, buscar un omologo para GNU/Linux o de plano desarrollar una aplicación nativa para GNU/Linux, o como has comentado una aplicación PHP/MySQL (si es que cumple con los requisitos)