Disculpa tienes razón, no me funcionó porque colocandolo de esa manera no me guardo los documentos y antes si lo hacia. Lo coloqué asi:
    
Código PHP:
Ver original- if ($_POST['btn_enviar']) { 
-          $cantidad = count(($_FILES["archivos"]["name"])); 
-           for ($i=0;$i<$cantidad;$i++){ 
-            (move_uploaded_file($_FILES["archivos"]["ci"][$i],"../usuarios/doc/".$_FILES["archivos"]["name"][$i])); 
-          } 
-         } 
ci la trae por post y la guardo en la variable $ci. 
no se si lo pude mal.