Hola MataCuAZ, yo te recomiendo que uses el WS-FTP y lo que me causa un poco de duda, y si alguien más nos puede contestar, quedría resulta esa duda es lo que menciona fabiandiaz, es que subas con el mismo sistema operativo, eso si ya no entendí, cuando vas a subir información con un cliente FTP, te pregunta el tipo de servidor, en el caso de las interfases de Macromedia para subir contenido al sitio ftp busca de forma automática el tipo de servidor, ahora si llegases a utilizar el ws-ftp puedes decirle que también te lo identifique de forma automática y que selecciones la forma de transmisión de forma Binaria.
Por otro los servidores que no aceptan que los archivos tengan espacios en blanco por lo que de forma automática o renombran el archivo poniendolo como un nombre todo junto o te ponen los signos de porcentaje y bueno eso es lo que en mi muy humilde opinión te puedo comentar
