el mysql_connect no necesita decir a qué base de datos te conectas, lo que puedes hacer es:
Código PHP:
Ver original$query1 = "SELECT * FROM `base1`.`tablaN`";
$query2 = "SELECT * FROM `base2`.`tablaN`";
Ves? desde el código pudes seleccionar a cuál de las bases de datos consultar.
Saludos.