Bueno pues al final del día opte por hacer un objeto Routes que lea un XML y setee las rutas en el bootstrap 
   Código PHP:
    <?php
 
class Routes extends DOMDocument {
 
    protected $_source;
    protected $_filePath;
    private $_routes;
 
    public function __construct($filename) {
        $this->_filePath = $filename;
        parent::__construct($version, $encoding);
        $this->formatOutput = true;
        $this->preservWhiteSpace = true;
        $this->load($filename);
    }
 
    public function load($filename) {
        parent::load($filename);
        $this->parse();
    }
 
    public function add($id, $name) {
        $padre = $this->createElement("route");
        $padre->setAttribute('xml:id', $id);
        $inner = $this->createElement('cliente', $name);
        $this->firstChild->appendChild($padre);
        $padre->appendChild($inner);
        $this->save($this->_filePath);
    }
 
    public function remove($id) {
        $elemento = $this->getElementById($id);
        if(is_object($elemento)){
            $this->deleteNode($elemento);
            return $this->save($this->_filePath);
        }else{
            return false;
        }
    }
 
    public function parse() {
        if ($this->firstChild->hasChildNodes()) {
            foreach ($this->firstChild->childNodes as $ruta) {
                if (trim($ruta->nodeValue) != '')
                    $this->_routes[] = $ruta->nodeValue;
            }
        }
    }
 
    function deleteNode($node) {
        $this->deleteChildren($node);
        $parent = $node->parentNode;
        $oldnode = $parent->removeChild($node);
    }
 
    function deleteChildren($node) {
        while (isset($node->firstChild)) {
            $this->deleteChildren($node->firstChild);
            $node->removeChild($node->firstChild);
        }
    }
 
    public function get() {
        return $this->_routes;
    }
 
}    
  Y en un metodo init del Bootstrap  
 Código PHP:
    $routesXml = new Routes(Base::getConfig()->xml->routes);
if(count($routesXml->get())>0)
foreach($routesXml->get() as $cliente){
    $route = new Zend_Controller_Router_Route_Static( 
    $cliente, 
    array('controller' => 'portal', 'action' => 'index', 'cliente' =>$cliente)
); 
    $router->addRoute($cliente, $route); 
} 
    
  gracias :D compas