Mira una forma de explicarlo es la siguiente:
Este es un index.php
Código PHP:
Ver original<head></head>
<body>
<div id="contenedor">
<?php include ('sub_contenedor.php'); ?>
</div>
</body>
Este es una pagina sub_contenedor.php
Código PHP:
Ver original<div id="sub_contenedor">
<?php echo "Hola mundo"; ?>
</div>
El total de las dos seria este:
Código PHP:
Ver original<head></head>
<body>
<div id="contenedor">
<div id="sub_contenedor">
<?php echo "Hola mundo"; ?>
</div>
</div>
</body>
Ya con esto puedes llamar al CSS desde index.php y los estilos se cargaran a todos los contenedores que tengas en la pagina de resultado, así utilices CSS para un contenedor en común con su ID o para todos si utilizas estilos para todas las etiquetas DIV de tu pagina.
Espero que esto te sirva de inicio para lo que quieras hacer