Creo que para lo que es el registro en sí, no se usa el facebook connect, sino el facebook registration (
http://developers.facebook.com/docs/.../registration/).
Yo he implementado el facebook connect via ajax en mi página, y al obtener los datos básicos del usuario, hago un registro automático en mi web, ya que la authentication con facebook, dependiendo del "scope" que le indiques (los permisos que solicitas) te devolverá un json, a partir de ahí puedes hacer lo que necesites con esos datos, en mi caso, la primera vez que un usuario accede via facebook connect, si la authentication es correcta, creo un usuario nuevo, al cual relaciono con ese usuario de facebook mediante el "facebook id", así la próxima vez que acceda, se ignora la creación de un nuevo usuario, y en definitiva accede a su usuario de mi web.
Espero que te de una idea, cualquier duda estaré por aquí.