Hola, que tal, ya resolvi el problema.
Lo que pasaba es que como la carpeta que contenia el archivo footer.php estaba al mismo nivel que mi archivo index.php, la ruta para incluir los archivos dentro de index.php es :
<?php
include "lib/footer.php";
?>
y no
<?php
include "../lib/footer.php";
?>
------------------------------------------------------------
esto seria correcto:
<?php
include "../lib/footer.php";
?>
si mi sistema de archivos fuera el siguiente:
lib --> contenedora del archivo footer.php
footter.php
modulos --> contenedora del archivo principal.php
principal.php
index.php ---> pagina inicial
Y estuviera buscándolo desde principal.php.
Espero les sirva de ayuda.