
Podrías que en cada parte del código que deseas recorrer colocar una verificación de tiempo. Algo como
Código PHP:
Ver original
// codigo de php
// ...
if((time() - $start) > 3){ // código
}
// más código
// ...
if((time() - $start) > 3){ // código
}
// mas código
// ...
if((time() - $start) > 3){ // código
}