buenas,
no comprendo muy bien. ¿quieres tomar el contenido de un <div> que esta en el documento cargado en <iframe>? entonces, lo que debes analizar es si dicho documento esta en el mismo dominio al script que obtendra el contenido. si la respuesta es no, pues simplemente no se puede hacer debido a las póliticas del mismo origen que gobierna los scripts. si la respuesta es si, entonces debes accesar primero al objeto window generado por el iframe para entonces poder invocar getElementById desde el objeto document. comunmente puedes usar la coleccion
frames indicando como indice la posicion del frame que deseas accesar:
self.frames[0].document.getElementById....