Problemas con ejecutable

[novatoLIII]

Hola que tal? como andan?
Estoy haciendo un proyecto java , y estoy usando netbeans 6.9.1 , mi duda es la siguiente:
Respecto a los ejecutables por ejemplo pepe.exe se puede hacer que se ejecute dentro del proyecto?, no se si se entiende, osea agarrar y directamente colocarlo dentro de la carpeta q despeus voy a compilar para que no tenga q colocar aparte el .exe, me entienden? con las imagenes se puede hacer, pero con un ejecutable tambien se puede?
y no me refiero a usar el metodo
"Process p = Runtime.getRuntime().exec("pepe.exe");"
q aga eso mismo pero dentro del proyecto, alguien sabe como hacer? o podria darme algun consejo de como se peude hacer?
Desde ya muchisimas gracias, y disculpen mi ignorancia.

Saludos.
novatoLIII