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[masterpuppet]

Es que tenes un return en el while AplicaWeb, tienes que guardar en un array los datos y retornar el array.

Código PHP:

...
$resultSet = array();
while ($rowEmp = mysql_fetch_assoc($resEmp)) {
    $resultSet[] = $rowEmp['query'];   
}
return $resultSet;
...
 

todo esto suponiendo que query es un campo de la tabla queries