Nada, no les cobres nada, hazles el trabajo gratis :D, he dicho !!
Si no te gustó mi respuesta entonces no debiste haber preguntado en primer lugar. Debes tomar en cuenta cuanto tiempo te tomará terminar la aplicación, de ahi, deberás calcular, cuantos wats de energia electrica, comida, transporte, etc, requerirás durante ese tiempo, y sobre todo lo más valioso, tu tiempo, ponle un precio a tu trabajo por hora, ya tienes los datos, solo te restará hacer multiplicaciones sencillas; Te recomiendo que firmes un contrato para definir cuando y en condiciones la aplicacion será aceptada para que una vez firmado, note pidan más y más agregados; estos nunca estuvieron desde un comienzo y por lo tanto no estan en las especificaciones, asi que si el cliente los quiere, tendrán un costo adicional.
Como referencia, puedes echarle un vistazo al siguiente link.
http://www.scribd.com/doc/3787/Cuanto-Cobrar
Saludos.