Recomendación desarrollo en php

[AJDC]

Saludos...
Me estoy iniciando en el desarrollo con php.
Después de pequeñas pruebas y desarrollos, me he metido con un proyecto en "condiciones", que además creo que como meor se aprende, ya que sobre todo es más motivante, aunque me tope con más "paredes"...

Bien, la duda que planteo es la siguiente.

Como tengo que insertar, actualizar, consultar, eliminar registros de bds, veo que hay distintas formas..
- páginas php independientes que lo hagan y luego te redirijan...
- páginas con funciones a las que llamo...
- hacer includes ...
- etc

¿Cómo veis la mejor forma de organizar esos proyectos "mas grandes"?

Gracias