Has probado de la siguiente forma? Si el valor es numerico creo que va sin comillas, si tiene otro caracter diferente si se debe acotar. Creo que con esto podria funcionar.
Código PHP:
<SCRIPT LANGUAGE="JavaScript">
var isbn=<?php echo $valorIsbn; ?>;
</SCRIPT>
Antes de meter la variable en la función creo que es mejor tratar de imprimir a ver que sale para tratar de depurar el error que pueda estar generando o realizar algun tipo de conversión (de pronto en tu función se necesita un numero y lo que imprime es un cadena por ejemplo)
Perdon si repito tema pero el foro no me dejaba añadir la ultima modificacion.