Hola que tal,
Te recomiendo que cuando trates con efectos en javascript, utilizes la librería UI-JQuery te ahorra bastante código, evitas bugs entre navegadores y con la mejor optimización que puedas obtener, además de lo atractivo y poderoso que puede ser UI-Jquery.
Mira en tu caso puedes usar el widget "Dialog" con una cortina("modal=true") al abrir el video, por ejemplo el código podría ser:
$( "#MI_VIDEO" ).dialog( { modal: true } );
Esto provocará que el video se formatee para convertirse en una bonita ventana y atrás se pondrá un tipo de cortina que bloqueará la página.
Puedes agregar muchísimas opciones para tu ventana, por ejemplo: efectos, controles de eventos, métodos, temas de diseño con solo cambiar la url del css de UI, etc. etc.
En realidad lo que necesitas es sencillo como para abstenerse a este lujo de JQuery pero creéme que si te fías de JQuery, tu página será más dinámica y fácil de editar, además de que tendrás menos bugs.
Aunque te recomiendo que siempre hagas tus intentos para que no te quedes con el "Uff! soy tan mortal que núnca podré hacer un script como lo que hace JQuery".
Puedes ver como funciona entrando a la página oficial:
http://jqueryui.com/demos/dialog/
Saludos.