Entonces el tema está en eso mismo. Para verlos en la DB igual que en la aplicación necesitas, además de que esté todo codificado en UTF-8, archivos, charset, base de datos, también la operación de inserción y toma de datos.
En el caso de ser php, se debe utilizar la función
utf8_encode para mostrar los datos y
utf8_decode para insertalos.
De esta forma verás los datos igual en la aplicación y directamente en consultas a la db.