Si sigues esta ruta c:\windows\application data\identities, encuentras una carpeta con nombre de una numeración algo así como "{07C90749-F8A7-4E2F-A99D-BF31E2035866}", dentro hay un carpeta llamada "microsoft" y dentro de esta una llamada "outlook express".
Si la copias y la sustituyes por la que tienes en la instalación de windows actual te mantendrá los mensajes que tenias en las bandejas, eso si debes tener la misma versión de Outlook.
Espero te sirva de ayuda, si no es así, coméntamelo pues esta ruta es seguro la que usan W98 y WMe, aunque quizá en W2000 sea otra la ruta donde se guarda, ahora no me acuerda muy bien, dime algo y ya lo miraré mejor, un saludo.