Tablas venta, compras, stock

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maneja una tabla de ventas donde registres cada venta, un detalle de venta donde iria los articulos, precio y cantidades, maneja otra tabla de articulos donde irian los datos del articulo y el precio, las cantidades, si solo tienes un almacen, guardalas en la tabla articulos, sino crea una tabla de almacenes, y otra de inventario donde iria la cantidad que tiene x almacen de x articulo y que deberia cuadrar con la cantidad que tiene el articulo (que seria sumo de las cantidades de ese articulo en todos los almacenes). Cuando hagas ventas creas el registro en ventas, los registros en detalle ventas necesarios y vas descontando cantidades en la tabla articulos y en caso de tener varios almacenes para el mismo articulo, descontar del almacen correspondiente.
puedes tener una tabla de recepcion de articulos que te permitira saber cuantos articulos has comprado (es decir, estaria la cantidad total de articulos que has comprado, asi los hayas vendido), esta te servira para reportes de eso y sobre todo para cuadrar cantidades.

Espero te sirva mi chorote, esta muy al hay se va mi planteamiento de tablas pero por ahi va el asunto para algo basico de venta de articulos.