Webmastertools y GA juntas o separadas

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Para mis proyectos, procuro tener mis webs separadas tanto en WmTools como en Anlytics, sobre todo por aquello de que algun enlace se me escape o entren enlaces a la vez en dominios que tienen el mismo usuario de wmtools o Analytics, pero a medida que los proyectos y webs crecen , se me esta empezando a ir la pinza ( logueado deslogueado etc)

Influye que tus webs esten en el mismo usuario de GA y wmtools , si por ejemplo entran del mismo origen 4 enlaces ( de un post creado ) a 4 webs distintas que comparten GA t wmtools

peligro de baneo por ejemplo.