Ya lo solucione y lo muestro para que aporte a futuras generaciones
 
la primera parte de código  quedo asi   
 Código PHP:
    for($i=0;$i<=$_SESSION['cuenta_seg']-1;$i++){
            $_SESSION['segmento'][$i]=$_POST['segmento'.$i];
            $_SESSION['metodo'][$i]=$_POST['metodo'.$i];
            $_SESSION['hora'][$i]=$_POST['hora'.$i];
            
            
    } 
    
  y para imprimir todas las variables guardadas en la sesion queda asi   
 Código PHP:
    <?php 
        for($r=0;$r<=$_SESSION['cuenta_seg'];$r++){ 
             echo"<tr>";    
        echo "<td><input style='border:none' type='text' name='segmento".$r."' id='segmentos".$r."' value='".$_SESSION['segmento'][$r]."' ></td>";
        echo "<td><input style='border:none' type='text' name='metodo".$r."'   id='metodo".$r."'    value='".$_SESSION['metodo'][$r]."'   ></td>";
        
        if($r==$_SESSION['cuenta_seg']){
                echo "<td><input style='border:none' type='text' name='hora".$r."'     id='hora".$r."'      value='".date("H:i:s")."'></td>";
        }
        else{
             echo "<td><input style='border:none' type='text' name='hora".$r."'     id='hora".$r."'      value='".$_SESSION['hora'][$r]."'></td>";
        }
        
        //echo "<td><input style='border:none' type='text' name='hora".$r."'     id='hora".$r."'      value='".date("H:i:s")."'></td>";
        echo "</tr>";
        }
    
 
   ?>    
  muchas gracias y ojala les sirva mi solución    

