Cita:
Iniciado por zerokilled 
buenas,
lo más seguro debe ser que el servidor no procesa los archivos *.js. es decir, la extensión *.js no esta registrada en el servidor para que el lenguaje de servidor (aspx) analice cualquier código posible que aparezca en dichos documentos. tienes dos opciones. una es configurar el servidor registrando dicha extensión -deberás consultar el manual del servidor http para determinar como se hace. la otra opción es en lugar de tener un archivo *.js, cambiarlo a *.aspx. luego debes crear un encabezado http -header- para sobreescribir el Content-Type a text/javascript.
Gracias por tus comentarios
Pero no creo que el servidor no pueda procesar los archivos JS... la pagina web con la que tengo prpoblemas puede ejecutar funciones de javascript en el archivo externo "Funciones.JS" nada mas que no contengan caracteres <%= %> como lo comenté en el inicio del post.
Un punto a conciderar es que estoy usando masterpage en esta pagina no se si esto revuelva al aspx y no pueda ubicar el gid o las cajas de texto dentro de que frame estan si en la pagina master o en la actual.