No entiendo que quieres hacer con ese código, pero tiene muchos errores de sintaxis, tal vez algo así:
Código PHP:
Ver original<?php
$actualFile = basename($_SERVER['PHP_SELF']);
if ($actualFile == "index.php") {
echo '<li class="here">';
echo '<a href="' . $actualFile . '" title="Inicio">Inicio</a>';
echo '</li>';
} else {
echo '<li class="clase2">';
echo '<a href="' . $actualFile . '" title="Otra página">Otra página</a>';
echo '</li>';
}