Hay muchas utilidades dedicadas al borrado seguro,
Active Kill Disk (
http://www.killdisk.com/) por poner una de ellas o
DBAN (
http://www.dban.org/download) que es de código abierto y portable. Casi todas lo que hacen es sobreescribir el disco con ceros o con algún un otro valor aleatorio, en una o varias pasadas.