Esto es uso de MySQL, nada más. La estructura no es buena para hacer lo que pides, entre otras cosas porque la búsqueda es por texto bruto y si alguien escribe alguna pequeña variación de lo mismo va a haber problemas, pero bueno, con lo que tienes el count que buscas sería más o menos así, si no me equivoco:
Código:
SELECT c1.field_l1_lista_value, COUNT(*)
FROM field_c1_lista_value c1
INNER JOIN field_c2_lista_value c2 ON c1.field_l1_lista_value = c2.field_l2_lista_value
INNER JOIN field_c3_lista_value c3 ON c1.field_l1_lista_value = c3.field_l3_lista_value
GROUP BY c1.field_l1_lista_value
Esto ampliado a todas las tablas que tienes. Yo revisaría la estructura muy seriamente, porque trabajar con eso va a ser horroroso.