Es que no era para copiar y pegar, era para que te hagas una idea de como hacerlo, para obtener el EntityManager en el repositorio utiliza getEntityManager,
Código PHP:
Ver original$dql = $this->getEntityManager()->createQuery(...);
...
$count = Paginate::getTotalQueryResults($dql);
$paginateQuery = Paginate::getPaginateQuery($dql, $offset, $limitPerPage);
...