es correcto hacer este tipo de limpieza??

[pateketrueke]

Si se puede, pero el código está mal.

Código PHP:

  // MAL 
$a[$k][$v]=mysql_real_escape_string(strip_tags($a[$v])); 
 
// BIEN 
$a[$k]=mysql_real_escape_string(strip_tags($v));  
   

Deberías leer un poco de documentación al respecto, consulta el manual.