Necesitas un lector de correo en php. Hay varios, en
http://www.phpclasses.org/ hay varios desarrollos a diferentes niveles, dependiendo de qué tan avanzado estés en php.
La cosa sería algo así:
Haces un script que llame alguna clase de lectura de correo (que permita descarga de archivos) normalmente te entregarán el correo en una structura, o bien puedes irle pidiendo lo que te interese (asunto, mensaje, origen, archivos etc). Grabas el archivo descargado, y borras el email.
Esta tarea la debes planificar en un cronjob para que se ejecute cada cierto tiempo