google indexa de tu codigo html generado por los codigos que uses sea php java el que sea todo ello genera html codigo fuente en tu navegador
es decir en tu bd tienes links y los llamas sea por echo o como sea.
<a href="<?php echo $link_bd;?>">ir</a> codigo html y php y datos de bd
esto imprime
<a href="http://miweb.com">ir</a> aqui generas solo html en tu web y de ay indexa