He estado probando otros códigos y he encontrado la solución, el problema no estaba en la SQL si no en hacer un bucle. Gracias por la ayuda.
El código definitivo es:
Código PHP:
define("TBL_IMG_SUBS", "sub_cats");
$arbol = $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'];
$subcat = $_GET['sub'];
$consulta_ig = mysql_query("SELECT carpeta_sub FROM ".TBL_IMG_SUBS." WHERE subcategoria = '$subcat'"); /
while ($registro = mysql_fetch_array($consulta_ig)) {
$i_carpeta = $registro['carpeta_sub'] ;
$s_carpeta = $arbol . $registro['carpeta_sub'] ;
}
mysql_free_result($consulta_ig);